La struttura Biodiversità e aree naturali protette è impegnata nella progettazione e realizzazione di diversi progetti europei, da sempre occasione di crescita, confronto e stimolo, nonché di acquisizione di risorse finanziarie.
I sette progetti attualmente in corso sono finanziati dal Programma di cooperazione transfrontaliera Interreg V-A Italia-Francia ALCOTRA 2014/2020.