Per accrescere l'efficacia delle strategie di sviluppo, la Commissione sostiene la sperimentazione in loco di nuove idee, consentendo così alle regioni di affrontare la sfida della società dell'informazione e di aumentare la loro competitività economica.
E a questo scopo ha indicato tre temi come quadro di riferimento per gli interventi del FESR in questo campo nel periodo 2000-2006:

	•	l'economia regionale fondata sulla conoscenza e sull'innovazione tecnologica;
	•	eEuropa-Regio: le nuove tecnologie dell'informazione al servizio dello sviluppo regionale;
	•	l'identità regionale e lo sviluppo sostenibile.

(Programma interessante la Valle d'Aosta: proposta di programma regionale di azioni innovative cofinanziato dal FESR per il periodo 2001-2003).

Sono inoltre previsti altri interventi innovativi a favore dell'occupazione e della formazione (finanziati dal Fondo sociale europeo) e nel settore della pesca (finanziati dallo SFOP).

Questi nuovi programmi, per i quali è stata stanziata una somma di circa 1 miliardo di euro, pari allo 0,5% del bilancio dei Fondi strutturali, serviranno a finanziare le strategie innovative e la fase sperimentale dei progetti, traendone indicazioni utili - nel caso di risultati positivi - per l'elaborazione dei criteri di attuazione degli obiettivi prioritari.